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从2015年2月1日10时起，大黄山至奇台、奇台至木垒和五彩湾至大黄山3条高速公路的16个收费站（含南泉子收费站），开始实行“入口领卡、持卡通行、出口交卡、凭卡交费”的封闭式联网IC卡管理收费，收费期限暂定为20年。
当日10时10分，记者驱车经过南泉子收费站时，收费员不收费，只递给记者一张IC卡。“从乌鲁木齐往奇台方向的车辆经过时，南泉子收费站是入口收费站，只给卡，不收费。车辆在出口收费站将IC卡交给收费员，收费员会按照行驶里程收费，并给驾驶员开纸质通行费券。”南泉子收费站站长黄文礼说。
一辆黑色轿车开进收费车道，停车、拿卡、抬杆、驶入高速，汽车通过仅用时5秒。
大黄山至奇台段高速公路，设三台、吉木萨尔、泉子街、奇台、中心团场、老奇台6处互通立交匝道收费站。奇台至木垒段高速公路，设双涝坝、木垒、博斯坦、大浪沙4处互通立交匝道收费站。五彩湾至大黄山段高速公路，设火烧山、南泉子两处主线收费站，五彩湾、红旗农场、三台油库和滋泥泉子4处互通立交匝道收费站。
车辆在经过路网中的第一个收费站时，车牌识别仪将车牌号码、车辆型号以及入口收费站信息存储在IC卡的芯片中，并备份在数据库中。当车辆在出口站刷卡交费时，收费员通过读取IC卡上的信息，根据车辆的行驶里程收费。
全国多地的高速公路都在使用IC卡联网封闭式收费方式，新疆和硕至库尔勒高速公路2006年开始使用IC卡联网封闭式收费方式，是全疆首家采用IC卡智能交费系统的公路。2012年11月，库阿高速公路（库车至阿克苏高速公路）也开始使用该收费方式。
